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（1）按污染物質成分分類
有機污染
主要來源于混合液中的大分子有機物（多糖、蛋白質等），腐殖酸類，微生物絮體、細胞碎片等。其中溶解性有機物SMP、EPS雖然對于MLSS來說占比非常低，但是它們所造成的膜污染占到26%-52%。微生物在膜孔內及膜表面生長、吸附作用也是膜污染的重要因素。
無機污染
由金屬鹽類，無機鹽離子架橋作用形成。膜的常見無機污染主要是鈣、鎂、鐵、硅等的碳酸鹽、硫酸鹽及硅酸鹽的結垢物質，其中碳酸鈣、硫酸鈣、氫氧化鎂較多。
（2）按污染物的性質分類
可逆污染（暫時污染）：可以通過一定的水力措施進行去除膜污染；如通過清水反洗、曝氣抖動可以去除的。
不可逆污染（長期污染）：不能通過水力清洗措施去除的膜污染，可以通過用氧化劑、酸、堿、還原劑等清洗進行去除的。
可逆和不可逆，都是可以洗出來的。任何清洗手段都洗不出來的就叫不可恢復性污染。
（3）按污染物的位置分類
混合液中的物料在膜孔內吸附、濃縮結晶、集中形成的叫內部污染；在膜表面的集中和沉積形成的叫外部污染。
